Положениями Федерального закона от 18.07.2017 N 163-ФЗ предусмотрено, что положения пункта 5 статьи 82 Налогового кодекса применяются к камеральным проверкам деклараций (расчетов), представленных в налоговый орган после дня вступления в силу Федерального закона N 163-ФЗ. Также указанная норма применяется к выездным проверкам и проверкам полноты исчисления и уплаты налогов по сделкам между взаимозависимыми лицами, решения о назначении которых вынесены налоговыми органами после дня вступления в силу данного Закона.
В ведомстве напомнили, что согласно пункту 5 статьи 82 Кодекса, доказывание обстоятельств, предусмотренных пунктом 1 статьи 54.1 Кодекса, и (или) факта несоблюдения условий, предусмотренных пунктом 2 статьи 54.1 Кодекса, производится налоговым органом при проведении мероприятий налогового контроля в соответствии с разделами V, V.1, V.2 настоящего Кодекса.
ФНС отмечают, что представители налоговых органов не должны ссылаться на положения статьи 54.1 Кодекса в ходе судебных разбирательств, а также при подготовке процессуальных документов, при оспаривании решений налоговых органов по результатам камеральных и выездных проверок, начатых до вступления в силу Федерального закона N 163-ФЗ.